据《国家自然科学基金会项目指南》等资料称，从1999年我国在自然科学基金中专门批一块约每年100万元支持约10个研究项目。该书92页如下：
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十一.复杂性科学研究专款项目申请指南
复杂性科学主要研究复杂系统与复杂性。尽管目前它仍处在萌芽和发展形成阶段，但已引起了科学界的广泛重视。
复杂系统的研究可分为三个层次：物理层次。生物层次和社会层次。复杂性科学有三个主要特点：研究对象是复杂系统；研究方法是定性判断与定量计算相结合，微观分析与宏观分析相结合，还原论与整体论相结合，科学推理与 哲学思辩相结合；研究深度不限于对客观事物的描述，而是着重于揭示客观事物构成的原因及其深化的历程，并力图尽可能准确地预测其未来的发展。
21世纪的科学更加突出学科的相互交叉和融合，以多学科交叉、渗透和融合为重要特点的复杂性科学将在人类探索各种未知的科学奥秘中发挥重要的作用并将推动整个科学的发展，鉴于发展复杂性科学的重要性，国家自然科学基金委员会决定自1999年起拨专款资助复杂性科学的研究，鼓励不同学科背景的科学家在这个领域进行积极的探索。
复杂性科学研究资助的主要领域包括：复杂性科学的理论与方法，物理层次复杂系统、生物层次复杂系统、社会层次复杂系统的研究等。
1999年复杂性研究资助9个项目100万经费。2000年复杂性科学研究专款总额仍为100
万，拟资助研究项目数约10个左右。由管理科学部负责受理项目申请，按面上项目自由申请类进行管理。学科代码第一栏请填写管理科学部的代码（G0113或其下属代码），根据研究内容在学科代码的第二栏中填相关科学部的代码。
鼓励研究领域
·复杂系统的演化。涌现、自组织、自适应。自相似的机理研究
·金融避险与经济动力学
·脑高级功能的复杂性
·灾害系统
·复杂系统与复杂性研究的典型方法，如演化计算、无胞自动机、多智能体（Multi-Agents）等